alloscardovia omnicolens в посеве что значит

Морфология бифидобактерий

МОРФОЛОГИЯ и СИСТЕМАТИКА БИФИДОБАКТЕРИЙ

Рис.1. Рост бифидобактерий в полужидкой питательной среде.

На рисунке 1 приведены фотографии нескольких культур, на которых видны особенности роста бифидобактерий в полужидкой питательной среде Бифидобактерии при культивировании в полужидкой питательной среде образуют характерные образования в форме «кустиков» или «комочков». На рис.1а представлены характерные для бифидобактерий «колонии-гвоздики», рис.1б – «колонии-сгустки», рис.1в, г – «колонии-столбики».

Морфология бифидобактерий

Морфология (биология) — наука о форме и строении организмов

Все представители рода Bifidobacterium – грамположительные, неподвижные, неспорообразующие, не образующие в процессе жизнедеятельности газы, анаэробные (однако, некоторые виды могут быть аэротолерантными), каталазо-отрицательные (кроме Bifidobacterium indicum и Bifidobacterium asteroides), сахаролитические микроорганизмы (Biavati et al., 2000; Leahy et. al., 2005). Все они хемоорганотрофы, активно сбраживают углеводороды с образованием преимущественно уксусной и молочной кислот в молярном соотношении 3:2, СО₂ не образуют. Некоторые виды могут расти в атмосфере, обогащенной до 10% СО₂. Их рост прекращается при рН ниже 4.5 или выше 8.5. Как правило, при окрашивании препарата бифидобактерий по Граму, для них характерна биполярность. Однако и это правило не без исключения, так как некоторые штаммы бифидобактерий при прокрашивании приобретают вид клеток, содержащих гранулы, что не отвечает характерной для бифидобактерий биполярности. Иногда они похожи на цепочку кокков (Biavati et al., 2006).

Все описанные на данный момент виды бифидобактерий распределены по следующим основным экологическим нишам: кишечник человека, полость рта, вагинальная полость, желудочно-кишечный тракт животных (Бондаренко и др., 2007), кишечник насекомых, кисломолочные продукты и сточные воды (табл.1). Однако две последние экониши – это вторичные места обитания бифидобактерий (Домотенко и др., 2014).

ВИДЫ (ТИПОВЫЕ ШТАММЫ) БИФИДОБАКТЕРИЙ

Таблица 1. Типовые штаммы видов рода Bifidobacterium, их обозначения в мировых коллекциях микроорганизмов и происхождение

DSM – Deutsche Sammlung von Mikroorganismen: Германская коллекция микроорганизмов и культур клеток
ATCC – American Type Culture Collection: Американская коллекция штаммов, клеточных линий и других биоресурсов для контроля качества и научных исследований (Манассас, VA, США)
LMG – Bacteria Collection Universiteit Gent: Бельгийская координированная коллекция микроорганизмов, Гентский университет

История систематики бифидобактерий (таксономия)

Впервые описал бифидобактерии Тисьер примерно в 1900 году (Poupard et al., 1973). Он выделил из фекалий вскормленного грудью младенца культуру анаэробных бактерий, клетки которых обладали специфической Y-образной морфологией. Тисьер дал им название Bacillus bifidus. Позже Холланд назвал штамм, выделенный Тисьером Lactobacillus bifidus (Holland, 1920). А в 1924-ом году Орла-Йенсен отнёс род Bifidobacterium к отдельному таксону* (Orla-Jensen, 1924; Prasanna et al., 2014).

*Таксон — группа в классификации, состоящая из дискретных объектов, объединяемых на основании общих свойств и признаков. Классификационные системы, использующие понятие «таксона», обычно носят иерархический характер

В 1957-м году Денерт впервые обнаружил существование множества биотипов внутри рода Bifidobacterium и предложил систему дифференцировки пяти групп этих бактерий, которая была основана на характере сбраживания ими углеводов (Dehnert, 1957).

На основании биохимических и серологических характеристик, вдобавок к уже известной на тот период B. bifidum, Реутер в 1963-м году выделил ещё семь видов бактерий, относящихся к роду Bifidobacterium, и предложил схему их идентификации. В роде Bifidobacterium Реутер выделял следующие виды: B. bifidum var. a и b; B. infantis; B. parvulorum var. a и b; B. breve var. a и b; B. liberorum; B. lactentis; B. adolescentis var. a, b, c и d; B. longum var. a и b (Reuter, 1963).

В 1969-м году Митсуока предложил иную схему классификации бифидобактерий. По ней, во-первых, к виду B. longum были добавлены два новых биотипа (B. longum subsp. animalis a и b), а во-вторых, к уже известному разнообразию бифидобактерий было добавлено два новых вида (B. thermophilum и B. pseudolongum), выделенных из фекалий животных (Mitsuoka, 1969).

В том же году Скардови с сотрудниками выделили из рубца крупного рогатого скота B. ruminale (впоследствии оказалось, что этот вид идентичен B. thermophilum) и B. globosum (Scardovi et al., 1969). Тогда же Скардови и Трователли выделили из кишечника медоносных пчёл три новых вида (B. asteroides, B. indicum и B. coryneforme) с морфологией отличной от уже известных представителей этого рода (Scardovi, Trovatelli, 1969).

Благодаря использованию молекулярных методов, а именно анализу сиквенсов 16S рибосомальной РНК/ДНК, удалось грамотно классифицировать представителей рода Bifidobacterium (Ventura et al., 2007; Downes et al., 2010).

Род Bifidobacterium также как Gardnerella (типовой и единственный вид – Gardnerella vaginalis (Greenwood, Pickett, 1980) были включены в одно семейство Bifidobacteriaceae, которое отнесли к порядку Bifidobacteriales в подклассе Actinobacteridae в классе Actinobacteria в отделе Firmicutes в домене Bacteria. Позднее в семейство Bifidobacteriaceae были включены ещё пять новых родов: Aeriscardovia (единственный вид Aeriscardovia aeriphila, ранее известен как «Bifidobacterium aerophilum» (Simpson, 2004), Alloscardovia (типовой и единственный вид – Alloscardovia omnicolens (Huys et al., 2007), Metascardovia (типовой и единственный вид – Metascardovia criceti (Okamoto et al., 2007; Anderson et al., 2013), Parascardovia (типовой и единственный вид – Parascardovia denticolens (Jian, Dong, 2002), ранее известен как «Bifidobacterium denticolens» (Milani et al., 2013) и Scardovia (на сегодняшний день известно к этому роду относятся два вида: типовой вид – Scardovia inopinata, ранее известен как «Bifidobacterium inopinatum», и Scardovia wiggsiae (Downes et al., 2010).

Только практически полное определение последовательности генов 16S рРНК у исследуемых штаммов бактерий и их сравнение с аналогичными последовательностями, помещенными в международную базу GenBank, позволяет говорить точно об их отношении к роду Bifidobacterium (или др. родам).

На рисунке 3 представлены микрофотографии, демонстрирующие типичную для представителей рода Bifidobacterium клеточную морфологию.

Рис.3. Микрофотографии окрашенных метиленовым синим фиксированных препаратов некоторых выделенных бифидобактерий (х100 иммерсия ).

На рис.3 а, б представлены скопления в виде «вилочек», которые являются типичными для бифидобактерий. На рис.3 в, г наблюдаются утолщения на концах в виде «булав».

Таблица 2 ‑ Дифференцирующие особенности биологических свойств бифидобактерий

Рис. 5. Филогенетическое древо желудочно-кишечного тракта человека, относящегося к семейству Bifidobacteriaceae. Регистрационные номера последовательностей генов SSU рРНК из базы данных GenBank предоставлены для каждого вида.

Итак, конкретные виды Бифидобактерий (Bifidobacteria spp.) принадлежат к роду Bifidobacterium, из семейства Bifidobacteriaceae в отряде Bifidobacteriales, принадлежащему к типу Актинобактерий (Actinobacteria)

Актинобактерии распространены и обильны в желудочно-кишечном тракте человека. Они также известны как грамположительные бактерии с высоким содержанием гуанина и цитозина ( G + C ) в их ДНК. Поскольку их особенно трудно лизировать, а их малая субъединица рибосомной РНК ( SSU rRNA ) нуждается в специфических ПЦР-праймерах для амплификации (Satokari et al., 2001), эта группа бактерий часто недостаточно представлена ​​в молекулярных исследованиях желудочно-кишечной микробиоты (особенно в одном из первых глобальных исследований микробиоты младенцев; Palmer et al., 2007). Члены отрядов Bifidobacteriales (в частности, Bifidobacterium spp.) и Coriobacteriales (в основном, Collinsella spp.) широко распространены уже с молодости.

Бифидобактерии Bifidobacterium spp. образуют доминирующую фракцию желудочно-кишечной микробиоты человека, особенно у младенцев (Benno et al., 1984). Бифидобактерии присутствуют в количестве от 10 8 до 10 10 клеток на 1 г кишечного содержимого (Finegold et al., 1974; Moore & Holdeman, 1974a; Tannock, 1995). Большинство видов Bifidobacterium spp. были получены исключительно из желудочно-кишечных проб человека или животного, и для двух видов (B. minimum and B. subtile), которые были выделены из сточных вод (Scardovi & Trovatelli, 1974), можно предположить кишечное происхождение, что свидетельствует о высокой адаптации этого рода в желудочно-кишечном тракте. Филогенетически, Bifidobacterium spp. образуют однородную группу, с 20 культивируемыми* видами, связанными с желудочно-кишечным трактом человека (см. рис.5).

*По последним данным видов установлено более 50 (см.: Martinez, F.A.C. Bacteriocin production by Bifidobacterium spp. A review. / F. A. C. Martinez, E. M. Balciunas, A. Converti, P. D. Cotter, R. P. de Souza Oliveira // Biotechnol. Adv. – 2013. – Т. 31. – № 4. – C. 482–488.)

Будьте здоровы!

ССЫЛКИ К РАЗДЕЛУ О ПРЕПАРАТАХ ПРОБИОТИКАХ

Источник

Новые уропатогены

Введение

Технологические достижения, сделанные в последние годы, в идентификации бактерий с помощью молекулярной биологии и масс-спектрометрии или Матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации (MALDI-TOF) позволили выявить новые бактерии, участвующие в инфицировании мочевыводящих путей. Цель нашей работы донести эту информацию до клиницистов различных отраслей для прицельной работы с целевой группой населения и помочь бактериологам заподозрить и идентифицировать эти патогены.

Методы

Выполнен обзор литературы базы данных MEDLINE с помощью ключевых слов: Aerococcus, Actinobaculum, Alloscardovia, Trueperella.

Результаты

Если Aerococcus более менее хорошо известен, то Actinobaculum, Alloscardovia, Trueperella редко встречаются и практически незнакомы клиницистам. Значение этих микроорганизмов было недооценено ранее ввиду сложности их выявления. Чаще всего их находят у возрастных пациентов и они лежат в основе заболевания или фактора риска инфекции мочевыделительного тракта. Actinobaculum schaalii также можно найти у маленьких детей.

Заключение

Aerococcus sp. и A. schaalii реальные уропатогены о которых не стоит забывать. Для того же что б подчеркнуть особую роль Trueperella sp. и Alloscardovia sp в развитии урологической патологии необходимы дальнейшие исследования

Ключевые слова

Уропатогены, Aerococcus, Actinobaculum, Alloscardovia, Trueperella.

Mise au point : les uropathogènes émergents

C. Le Brun, S. Robert, F. Bruyere, P. Lanotte

Журнал «Достижения в Урологии» (Progrès en Urologie ), Июнь 2015, стр 363-369

Источник

Бифидобактерии

История обнаружения

Бифидобактерии (Bifidobacterium) впервые были выделены в кале грудного младенца в 1900 году. Первооткрыватель этих микроорганизмов — французский ученый Тисье (Tissier), который доказал их важное значение в формировании иммунитета ребенка. Он дал им название Васillus bifidus communis.

Тогда же русский микробиолог И. Мечников занимался исследованием диспепсии и подтвердил важность этих бактерий в создании симбиотической нормофлоры человека. В 1924 году Орла-Йенсен (S. Orla-Jensen), исследовавший свойства микроорганизмов, предложил переименовать бактерии в Bacterium bifidum. Это название стало основой для названия Рода Bifidobacterium, а также, впоследствии — для названий Семейства и Порядка.

Внешний вид под микроскопом

Бифидобактерии — полиморфные палочки, окрашивающиеся по Грамму. Часто имеют раздвоенные концы, что и стало основой для их названия (bifidus — раздвоенный). Такая Y-образная форма с булавовидными утолщениями преимущественно встречается на жидких средах, бедных питательными веществами, а также в старых культурах. Свежевыделенные микроорганизмы, как и колонии бактерий, выращенные на богатых средах, состоят в основном из палочковидных форм, иногда в виде цепочек.

Где обитает

Бифидобактерии являются типичными представителями флоры кишечника человека и животных. У младенцев, которые находятся исключительно на грудном вскармливании, этот род микроорганизмов доминирует, составляя порядка 90% всего микробного ценоза. Они населяют весь кишечник, поднимаясь до проксимального отдела тонкой кишки.

Классификация

Царство
Bacteria

Тип
Actinobacteria

Класс
Actinobacteridae

Порядок
Bifidobacteriales

Семество
Bifidobacteriaceae

Род
Bifidobacterium
Gardnerella
Aeriscardovia
Alloscardovia
Metascardovia
Parascardovia
Scardovia

Свойства

Bifidobacterium является неспорообразующим микроорганизмом, способным существовать только в анаэробной среде. Температура, оптимальная для развития этих бактерий +35°С. Однако они способны сохранять способность к размножению даже при +42… +46°С. Синтезируют ряд аминокислот, многие витамины группы В и витамин К. В процессе жизнедеятельности образуют молочную, уксусную, пантотеновую, фолиевую и муравьиную кислоту, цанкоболамин и пиридоксин.

Функции

В качестве симбионтов кишечной микрофлоры бифидобактерии играют немаловажную роль в процессе нормального пищеварения. Они обеспечивают организм хозяина витаминами, стимулируют перистальтическую активность кишечника.

Bifidobacterium относится к важным факторам формирования иммунитета организма. Вырабатывая молочную и уксусную кислоту, они создают неблагоприятную среду для развития патогенных и гнилостных микроорганизмов, являясь таким образом их антогонистами. Эти бактерии участвуют в синтезе иммуноглобулинов и, уничтожая патогенных микроорганизмов, играют антиканцирогенную роль. Антитоксичная и антиканцерогенная функция бифидобактерий проявляется также в их способности поглощать тяжелые металлы, фенолы и многие другие токсины.

Мурамил-дипептид, содержащийся в клеточной оболочке бифидобактерий, способен активизировать образование макрофагов, Т- и В-лимфоцитов, отвечающих за стабильность иммунного ответа организма хозяина на антигены бактерий и вирусов.

Не так давно была обнаружена еще одна способность бифидобактерий — они могут снижать концентрацию холестерина в сыворотке крови и нормализовать уровень фосфолипидов и липопротеинов в крови. Благодаря этому стабилизируется метаболизм жиров в организме человека.

Источник

«Мазок на флору»: о чём расскажет анализ?

Исследование «Мазок на флору» относится к микроскопическому виду анализа. Тест назначают при подозрении на инфекционный процесс репродуктивных органов.

Для проведения анализа необходимо получить мазок. У мужчин биотопом является уретра, у женщин — цервикальный канал, влагалище, уретра. Исходя из места локализации патологического процесса, врач может направить женщину сдать мазок только из влагалища или цервикального канала. Однако чаще требуются все три локуса сразу.

Взятие мазка — процедура безболезненная и безопасная. Все беременные женщины также сдают мазок минимум три раза: первый визит, 30 и 36 неделя, при условии нормально протекающей беременности. Полученный мазок переносится на стекло, высушивается и окрашивается, после чего врач-лаборант исследует препарат под микроскопом и описывает его. Бланк результата содержит информацию о микрофлоре, лейкоцитах, эпителиальных клетках и патологических агентах.

Микрофлора

В процессе анализа врач описывает её тип, обильность. В норме должна преобладать палочковая флора. Палочки являются представителями лактобактерий, поддерживают определенный уровень pH. Основная роль палочек — защита влагалища от болезнетворных микроорганизмов и стимулирование местных реакций иммунитета. Когда в мазке присутствует иные бактерии, например, кокковые, число палочек снижается. Такое состояние указывает на дисбиоз и требует обязательной коррекции.

Лейкоциты

Лейкоциты в мазке позволяют судить о наличии воспалительной реакции. Число лейкоцитов в графе «результаты» указывается через дефис. Первая и вторая цифры соответствуют минимальному и максимальному числу, обнаруженному в полях зрения микроскопа. Для каждого локуса есть свои референтные показатели. В цервикальном канале допустимо не больше 25 клеток в поле зрения, в уретре — не более 5, во влагалище — не более 10.

Увеличение абсолютного число лейкоцитов говорит о воспалении, поэтому необходимо получить консультацию гинеколога или уролога.

Эпителий

Эпителиальные клетки в препарате располагаются пластами или разрозненно в виде отдельных клеток. В мазке их число должно быть единичным. В случае увеличения количества клеток эпителия, врач указывает: умеренно — означает, что в одном поле зрения находятся до 10 эпителиальных клеток, много — до 20, обильно — свыше 25.

Изменение размера и морфологии клеток эпителия, могут косвенно говорить о воспалительной реакции или о проблемах гормонального характера. Клетки эпителия, покрытые по всей поверхности кокками, носят название «ключевых клеток». Обнаружение их в мазке является морфологическим критерием бактериального вагиноза.

Слизь

Значения «мало», «умеренно», «отсутствует» являются вариантом нормы. Если слизь присутствует в большем количестве, то это признак дисбиотических нарушений во влагалище.

Патологические элементы

В мазке врач может идентифицировать мицелий и споры дрожжеподобных грибков, трихомонады, актиномицетов, сперматозоиды и др. Но определить точную видовую принадлежность возбудителя не сможет из-за ограничений метода. Например, в урогенитальном тракте человека обитают несколько представителей рода Neisseriaceae, которые похожи между собой, поэтому отличить в стандартном микроскопе не представляется возможным.

Диагностическая чувствительность микроскопии при диагностике гонококковой инфекции в России составляет 30%, а трихомонадной инфекции — 44–68%. Микроскопия носит описательный характер, для точного определения вида возбудителя необходимо использовать молекулярно-биологические методы (ПЦР, NASBA) и культуральный метод.

Источник

Посев на микрофлору отделяемого ЛОР-органов с идентификацией микроорганизмов, в т.ч. кандида, методом времяпролетной МАСС-спектрометрии (MALDI-TOF) и определением чувствительности к основному спектру антибиотиков и антимикотиков

Описание

Посев на микрофлору отделяемого ЛОР-органов и тканей с определением чувствительности к основному спектру антибиотиков — это бактериологическое исследование, с помощью которого определяется количественный и качественный состав микрофлоры и её чувствительность к основному спектру антибиотиков.

Суть метода заключается в посеве исследуемого материала на питательные среды с целью выявления и идентификации чистой культуры возбудителя.

Микрофлора верхних дыхательных путей


В верхние дыхательные пути попадают пылевые частицы, нагруженные микроорганизмами, большая часть которых задерживается и погибает в носо- и ротоглотке. Здесь присутствуют бактероиды, коринеформные бактерии, гемофильные палочки, лактобактерии, стафилококки, стрептококки, нейссерии, пептококки. Трахея, бронхи, и альвеолы обычно стерильны.

Инфекционные заболевания
Инфекционные заболевания вызывают патогенные и условно-патогенные микроорганизмы. К условно-патогенным относят представителей нормальной микрофлоры человека, так как эволюционно они сохранили способность к паразитическому образу жизни. В отличие от патогенных микроорганизмов, они проявляют свои свойства при условии снижения сопротивляемости организма.

Определение чувствительности к антибиотикам проводится при выявлении роста 10 2 и более КОЕ/мл.

Определение дрожжеподобных грибов рода Candida и постановка чувствительности к антимикотическим средствам входит в данный анализ.

Интерпретация результатов
Интерпретация результатов исследования содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, учитывая результаты данного обследования и данные анамнеза, результатов других обследований и т.д.

На бланке результата указывается наличие или отсутствие роста; степень бактериурии, выраженная в КОЕ/мл, наименование возбудителя; степень бактериурии, выраженная в КОЕ/мл; чувствительность к антимикробным препаратам (определяется при бактериурии в титре более 104 КОЕ/мл).

В норме — рост микробной флоры отсутствует. При выделении ассоциации бактерий 10 5 КОЕ/мл и более является критическим. Повышение уровня говорит с большей вероятностью о развитии гнойной инфекции или генерализации процесса. При обсеменённости менее 10 5 КОЕ/мл раны заживают без явлений нагноения.

Внимание!
При обнаружении роста нормальной, сопутствующей и условно-патогенной флоры в низком титре, и не имеющей диагностического значения, определение чувствительности к антимикробным препаратам не проводится.

Источник